目前，官方認定的原住民族有阿美族、泰雅族、排灣族、布農族、卑南族、魯凱族、鄒族、賽夏族、雅美族、邵族、噶瑪蘭族、太魯閣族、撒奇萊雅族、賽德克族、拉阿魯哇族以及卡那卡那富族，共16族。各族群擁有獨特的文化、語言、風俗習慣與社會結構，而居住在花蓮縣的原住民族約有6族，包括人口數最多的阿美族、太魯閣族、撒奇萊雅族、噶瑪蘭族、布農族及賽德克族。

阿美族
太魯閣族
布農族
賽德克族
撒奇萊雅族
噶瑪蘭族
阿美族
花蓮縣內人口數：52,807人
來源：原住民族委員會原住民人口數統計資料（截至2023年3月）
阿美族主要分佈於花東兩縣，為台灣原住民人口數最多的一族。阿美族分佈在中央山脈東側，立霧溪以南，太平洋沿岸的花東縱谷及東海岸平原，大部份居住於平地，只有極少數居於山谷中。在原住民各族中漢化最深的阿美族，早已習慣顧犛耕及實施灌溉，採母系制度，子女從母，夫從妻居。
阿美族全臺人口約二十萬，其中分佈山地行政區者僅佔百分之零點五，其餘概為平地。從地域、習慣及語音的差異，可分為北部阿美，居住於今花蓮縣鳳林以北至花蓮市之間（如壽豐鄉、吉安鄉），又稱為南勢阿美。中部阿美，由於海岸山脈的分隔，又分為海岸阿美（如豐濱、大港口）與秀姑巒溪畔的秀姑巒阿美（如瑞穗、奇美）；南部阿美，居住於台東平原附近，也稱為台東阿美（如台東市、馬蘭、都蘭一帶）。
參考來源：台灣原住民族文化園區 http://www.tacp.gov.tw/
太魯閣族
花蓮縣內人口數：23,364人
來源：原住民族委員會原住民人口數統計資料（截至2023年3月）
太魯閣族在三、四百年前，為擴充耕地及狩獵區域而翻山越領，來到東部立霧溪、木瓜溪及陶塞溪等地區。花蓮縣的三個山地鄉（秀林、萬榮及卓溪鄉立山村）為太魯閣族分佈居住地。太魯閣族以勇猛強悍著稱，男性善長狩獵，女性善於織布，編織花色、圖紋無出其右者。
因族人自稱為Truku（太魯閣），所以遷移後的居住地才被稱為「太魯閣」地區。太魯閣（Truku）族語意為「山腰的平台」、「可居住之地」、為防敵人偷襲「瞭望台之地」，如今該地區即為太魯閣國家公園之範圍。而Truwan是現今的南投縣仁愛鄉合作村平生部落，包括Sadu、Bushi、Truwan、 Brayaw、Bushi Daya等五個部落，都是太魯閣族的根。
參考來源：台灣原住民族文化園區 http://www.tacp.gov.tw/
布農族
花蓮縣內人口數：8,406人
來源：原住民族委員會原住民人口數統計資料（截至2023年3月）
布農族是高山的民族，分為六大社群（卓、郡、丹、卡、巒等社群），分佈在南投、花蓮、台東、高雄縣等山區。布農族溫和謙恭、與世無爭，與大自然和諧共存，蘊育出獨特的八部合音，為世界獨一無二，享譽國際。每年4、5月的射耳祭為重要祭典，以山田栗作和狩獵為主，山溪捕魚、家畜飼養次之，蔬果採集布農族仍盛行，工藝技術包括削竹、藤竹編籃、結網、織麻、揉皮等。
布農族分布於中央山脈海拔一千至二千公尺的山區，廣及於高雄縣那瑪夏鄉、台東縣海端鄉，而以南投縣境為主。布農族全臺人口約四萬餘人，目前分佈於南投鄉之仁愛鄉；高雄縣之三民鄉、桃源鄉；花蓮縣萬榮鄉、卓溪鄉；以及台東縣延平鄉、海端鄉等。
參考來源：台灣原住民族文化園區 http://www.tacp.gov.tw/
賽德克族
花蓮縣內人口數：962人
來源：原住民族委員會原住民人口數統計資料（截至2023年3月）
傳說中賽德克族發源於中央山脈牡丹岩，經數次遷移來到今南投縣仁愛鄉境內Truwan之地定居。後因受限居住及耕作腹地不足，再次遷徙至Tgdaya、Toda、Truku等3個地區定居。在三百多年前，部分賽德克族人輾轉搬遷到現今的花蓮地區，發展出自己的文化，也演進了自己的語言。
賽德克族是由Seediq Tgdaya（德克達雅）、Sediq Toda（都達）、Sejiq Truku（德路固）等三語群的族人所組成，主要分佈在台灣本島中部、東部及宜蘭山區，包括祖居地南投縣的仁愛鄉，移居地花蓮縣秀林鄉、卓溪鄉及萬榮鄉，以及宜蘭縣大同鄉與南澳鄉。
參考來源：台灣原住民族文化園區 http://www.tacp.gov.tw/
撒奇萊雅族
花蓮縣內人口數：697人
來源：原住民族委員會原住民人口數統計資料（截至2023年3月）
撒奇萊雅族世居花蓮奇萊平原，北起立霧溪、南迄木瓜溪，東臨太平洋、西接奇萊山，早期建有十大部落。十七世紀荷西時期，文獻即記載著sakiraya，移墾的漢人亦將花蓮稱之為「奇萊」 (台語kilay)，足見數百年前，撒奇萊雅族實為花蓮北區一支強盛的族群。
西元1878年，大清帝國開山撫番，發動「達固湖灣戰役」(史稱加禮宛事件)，撒奇萊雅族與噶瑪蘭族聯合抗清不幸戰敗。戰後，清軍採取「勒遷以分其勢」的報復手段，使得殘存的族人被迫隱匿於阿美族部落中，或遠走他鄉重建家園。撒奇萊雅族從此在歷史的舞台上「消失」，成為流浪的民族。
民國96年1月17日，烽火漂泊129年之後，推動長達17年的正名運動終獲成功，撒奇萊雅族重返歷史舞台，成為官方所認定之台灣原住民族第13族。10月「火神祭Palamal」是為最重要的歲時祭儀祭典，開春舉辦的「長者賜福Hamaybaki」亦極為獨特，離村求生的「Misapunis舉村遠走野餐」教示族人同心離災、年齡階級種植刺竹保護部落、視刺竹尾端為祖靈託示等，均為其重要而獨特的習俗。
民族服飾部分以「土金」、「凝血」為主色，「海青」、「炭黑」、「泥褐」、「珠白」、「草綠」為輔色。女冠上之「刺竹圍牆」、「母親眼淚」，男冠上之「三角神印」、「壯羽飛揚」，以及冠帶垂腰的典故富饒意義。神之職「風吹、雨淋、土生、火燒」，及人之道「敬神、勤奮、自愛、愛人」則為最重要的祖訓。
參考來源：督固.撒耘
噶瑪蘭族
花蓮縣內人口數：677人
來源：原住民族委員會原住民人口數統計資料（截至2023年3月）
噶瑪蘭族是現今台灣平埔族群當中族群意識強烈、文化特質最鮮明的一群。原居於蘭陽平原（宜蘭縣），後因漢人墾地壓力而逐漸南遷，是最晚漢化的平埔族。目前以花蓮縣豐濱鄉新社村、新城鄉嘉里村為遷徙居住地。噶瑪蘭族以漁獵、農耕的社會生活型態，是原住民族最早耕作的族群之一。噶瑪蘭族早期以香蕉絲編織衣物及生活用品，今則以香蕉絲創意衣帽、飾品等手工藝品著稱。
大約是在1803到1840年間，噶瑪蘭族因為故地遭漢人佔據而向花蓮移民。主角以加禮苑社人為首，南遷到北埔建立加禮苑社，一部份則遷居南澳。直到1878年，加禮苑社噶瑪蘭人因不滿漢人再度入侵花蓮，聯合當地撒奇萊雅奇人發動加禮苑抗清事件，事敗後遠逃至東海岸與阿美族隔鄰而居。
參考來源：台灣原住民族文化園區 http://www.tacp.gov.tw/